在肿瘤相关蛋白定性研究中的应用

利用 shotgun 的蛋白组技术，可以实现对复杂样品中大量蛋白质的定性分析，进而为阐明肿瘤相关蛋白质的相互作用、信号通路组成及蛋白质亚细胞定位提供依据。

Dawson 等人发表于 2011 年《Nature》上的研究，利用蛋白组学的方法鉴定了肿瘤发生过程中参与染色质修饰失调的 bromodomain and extra terminal（BET）家族复合物的组成。作者首先分离出细胞核成分，再分别以 BET 抑制剂、Histone tails 及 BET 抗体为基质，通过免疫沉淀或 pull down 的方法分离出 BET 各蛋白亚型及其他蛋白复合物。利用 shotgun 的方法对分离的蛋白质进行鉴定，作者发现混合系白血病融合蛋白的分子伴侣 SEC 和 PAFc 是 BET 复合物的主要成员，并利用鉴定到的蛋白质构建了 BET 复合物蛋白相互作用网络。在此基础上，作者进一步证实 BET 复合物的功能与混合系白血病有直接关系，BET 是混合系白血 病的有效治疗靶点。