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实时荧光定量PCR的优化(二)
发布时间: 2021-10-12 点击次数: 1428次如果你所研究的靶序列有前人建立过实时荧光定量PCR的方法,就可以在公共数据库中查找,查看扩增效率、特异性、灵敏度等信息,省去从头开始的时间。
注意,使用前人建立的方法前,需要再次验证这个方法的参数是不是符合描述。防止长时间重复实验,却得不到想要的结果的人间惨剧。
推荐的公共引物探针数据库:
1、RTPrimerDB
这个数据库内的约6000个基因,来自人、拟南芥、大鼠等21个物种,相对其他数据库丰富。这些引物和探针,也是经过验证的,70%已发表。使用该数据库时建议通过网络代理登录。
2、PrimerBank
这个数据库内的探针引物是通过算法设计得到的,主要包括人和小鼠的基因。数据库内的小鼠引物,经过广泛验证后,被证实有83%的成功率。
3、Real Time PCR Primer Sets
这个数据库内的引物和探针都经过测试、优化,针对多种生物设计,包括人、小鼠、大鼠等的基因。
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